Năm 2009, anh gặp Tai nạn giao thông nghiêm trọng, mất trí nhớ và không thể tự sinh hoạt.

Tình yêu của Sỹ Luân và bà xã Phương Thảo (sinh năm 1992, hiện đang là Người dẫn chương trình, giáo viên tiếng Anh và tiếng Trung kiêm luôn quản lý của anh) bắt đầu vào năm 2013. Cả hai đều là Phật tử nên đã gặp gỡ và quen biết tại Chùa Hoằng Pháp, Thành phố Hồ Chí Minh. Nam ca sĩ ví mối tình của anh như một duyên số do trời sắp đặt bởi cả hai là những người luôn hướng về Phật pháp, thường xuyên đi chùa, làm công quả...

Tuy nhiên, bà xã Sỹ Luân không được lòng gia đình chồng nên suốt 6 - 7 năm yêu đương cũng gặp nhiều khó khăn.. Phải cho đến khi con gái đầu lòng - bé An Nhiên chào đời thì gia đình chồng mới có nhiều tình thương hơn, đặc biệt là rất quý em bé. Vợ chồng Sỹ Luân đang chung sống tại nhà riêng ở Quận 7, sau khi làm Lễ Hằng thuận tại Thái Lan.[3][4]